A、青霉属于多细胞的真菌，一般用放大镜就可观察其形态大小，不符合题意．
B、大肠杆菌属于细菌，细菌的个体十分微小，大约1000个细菌排成一排才有1毫米长，用肉眼、放大镜等都不可看，只有在高倍显微镜下才可看清，符合题意．
C、平菇属于多细胞真菌，个体较大，用肉眼就可观察，不符合题意．
D、根霉属于真菌，可以直接用肉眼来观察其形态，不符合题意．
故选：B
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