A,丙酮酸彻底氧化分解生成CO2的过程是有氧呼吸的第二阶段,该过程需要水的参与,A正确;
B、无氧呼吸的产物是二氧化碳和酒精或者乳酸,不产生水,B错误;
C、氧气参与有氧呼吸的第三阶段,与还原氢反应形成水,因此标记有氧呼吸消耗的氧气中的氧可在水中检测到,C正确;
D、蛋白质是氨基酸脱水缩合形成的,因此蛋白质水解过程需要水参与,D错误.
故选:B.
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