①基因工程的操作水平属于分子水平,其运用的原理为基因重组,即是在分子水平上对生物遗传作人为干预,①正确;
②基因治疗属于基因工程技术的应用,②正确;
③基因工程打破了生殖隔离,突破远缘杂交不亲和的障碍,③正确;
④DNA探针可用于病毒性肝炎的诊断、检测饮用水病毒含量,但是不能改造变异的基因,④错误.
故选:B.
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