由题意知,1000个氨基酸含有1020个氨基,1050个羧基,因此氨基酸的R基中含有20个氨基和50个羧基,由这些氨基酸合成的含有4条肽链的蛋白质中,游离的氨基═肽链数+R基中含有的氨基═4+20═24,游离的羧基数=肽链数+R基中含有的羧基数═4+50═54,肽键数═氨基酸总数-肽链数═1000-4=996.
故选:B.
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