选项A、豆科植物的根瘤菌将氮的化合物转变成植物蛋白属于生物固氮过程,故A错误;
选项B、闪电时氮气和氧气反应生成NO,是在自然条件下的氮的固定,故B错误;
选项C、N2与H2在一定条件下反应生成NH3属于工业合成氨的过程,属于人工固氮方式,故C正确;
选项D、由NH3生产各种化肥,是氮的化合物之间的转化过程,不属于氮的固定过程,故D错误。
故选:C.
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