A、基因突变是基因结构的改变，能产生新基因，因而是生物变异的根本来源和生物进化的原始材料，A正确；
B、基因突变的频率是很低的，B错误；
C、基因突变是不定向的，多数是有害的，C错误；
D、基因突变不一定改变生物性状，D错误．
故选：A．
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