A、生物进化的实质是种群基因频率的定向改变,A正确;
B、共同进化是指不同物种之间、生物与无机环境之间,相互影响,不断发展进化,B错误;
C、地理隔离不是新物种形成的必要条件,有的新物种可以不经过地理隔离而直接出现生殖隔离,如植物多倍体的形成,C错误;
D、最早登陆的生物是地衣植物,D错误.
故选:A.
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