蓝藻属于原核生物中的一种，酵母菌属于真核生物中的真菌。原核细胞和真核细胞最主要的区别就是原核细胞没有核膜包被的典型的细胞核。原核生物只有核糖体一种细胞器，而真核生物有核糖体、线粒体、叶绿体、液泡、溶酶体、中心体内质网和高尔基体八种细胞器；二者的共性是都有核糖体，都以DNA为遗传物质。蓝藻细胞内具有光合色素，能够进行光合作用，细胞内含有进行有氧呼吸的酶存在，也能够进行有氧呼吸的过程。A、蓝藻属于原核生物，有拟核，酵母菌属于真核生物，有核膜包被的细胞核，A错误；B.蓝藻和酵母菌均能进行有氧呼吸，B正确；C.蓝藻属于原核生物，没有线粒体，C错误；D.蓝藻能够进行光合作用，而酵母菌不能，D错误。故选B。
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