“不合宜者，渐渐消亡，其合宜者，得以永存，此为天道自然之力。但其说与耶稣之旨相反，故各国儒士，均不服其言，初始辩驳蜂起，今佩服者渐多，而格致之学从此大为改变。”材料评述的自然科学理论

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依据材料中“不合宜者，渐渐消亡，其合宜者，得以永存”信息结合所学可知，材料评述的自然科学理论是达尔文的生物进化论。生物进化论打破了神学的禁锢，把生物学建立在科学的基础之上，促进了欧洲的思想解放，因此C选项正确。A选项错误，生物进化论并未改变人们的宗教信仰，人们仍然信仰上帝；B选项错误，文艺复兴、宗教改革早已反对封建神学；D选项错误，材料评述的是生物进化论，与物理学的发展没有直接关系。故正确答案为C选项。

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