A、分子和原子的质量都很小,有的分子和原子的质量和大小可能相同,故A错误;B、分子和原子都是构成物质的基本粒子,因此分子和原子都可以单独存在,故B错误;C、分子和原子的本质区别是在化学变化中分子可以分成原子,而原子不能再分,故C正确;D、分子和原子都是构成物质的基本粒子,都具有微粒的特点:质量都很小、都在不停的运动、之间都有间隔,故D错误;故选:C.
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