多用嫁接繁殖。
乔化砧中应用较多的有秋子、山定子、新疆野苹果、八楞海棠及苹果实生苗等，其中以秋子最好。果实采下后立即压碎，取出种子，不能堆积沤烂，以免果肉发酵时产生高温，烧坏种子，降低出苗率。取出的种子，洗净阴干后，可放在通风处保存。春播前要经过沙藏。沙藏时间因树种而异，秋子100～200天，新疆野苹果80天左右，八楞海棠40～69天，国光苹果种子80～100天。翌春种子露白时，应即播种。为了防止幼苗立枯病发生，秋播时可用种子重量0.2%～0.3%的赛力散拌种，春播种子可在沙藏前拌种。条播或撒播。根据各地经验，苗木密度以行距50厘米，株距20厘米左右较为合理。有些地区也采用宽窄行种植，宽行行距50厘米，窄行行距25厘米。每667米2播种山定子1～1.5千克左右，覆土厚度2～3厘米。陕西省杨凌果农秋末冬初整好地开沟播种，覆沙轻踩，省去沙藏种子工序，出苗率极高。苗高6厘米时间苗，10厘米左右时定苗。6月中、下旬，幼苗旺盛生长阶段，要加强水肥管理。7月上、中旬，对高25厘米以上，但基部粗度不足0.3厘米的苗木，应进行摘心、培土、追肥、灌水，以促进粗生长，提高砧木利用率。嫁接方法主要用“T”字形芽接。芽接时间为7月中、下旬到9月上、中旬。砧木苗基部距地面6厘米处的粗度达到0.3厘米以上的，都可进行嫁接。芽接后，10～15天检查成活情况。接活的随时解除绑缚物，未接活的可在伤口下部再补接一次。第二年3月中旬到4月中旬，接芽萌发前，可从接芽上部一次剪去砧木苗干，不留桩，剪口呈30度斜角。为了保证接芽生长，砧干上的萌芽要及时抹除。近年来在芽萌动前多采用嵌芽接，生长期长，成苗率高。
矮化砧多数从国外引进，经全国矮化砧研究协作组确认半矮化砧有：M4、M7、MM106，矮化砧有M9和M26等。
矮化苹果苗有两种类型。一种是矮化自根砧苹果苗，即用矮化砧木直接嫁接苹果品种后培育而成的果苗。另一种是矮化中间砧苹果苗，它是用实生的乔化砧作基砧，在其上嫁接矮化砧种条作为中间砧，在中间砧上再嫁接苹果品种。
矮化自根砧木苗的繁殖可采用扦插繁殖。硬枝扦插、嫩枝扦插和根插均可，一般以根插为主，硬枝扦插时用吲哚丁酸1500毫克/千克溶液浸10秒钟，对于促进MM106的生根有良好效果，生根率达89%～92%。
在矮化自根砧木苗上嫁接苹果品种后，便成为矮化自根砧苹果苗。嫁接方法“T”形芽接、嵌芽接、枝接均可。
矮化中间砧苹果苗由三部分组成：基砧、中间砧、苹果品种。它需要嫁接两次。第一年春季播种培育实生乔化砧苗，秋季或第二年春季嫁接矮化砧；第二年春季剪砧培育中间砧砧苗，秋季或翌春嫁接苹果品种；第三年春季剪砧，秋后成苗。如在第二年夏季嫁接苹果品种，同时加强水肥等一系列管理，也可以做到两年出圃。
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