能观察到，健那绿染液是专一性染色线粒体的活细胞染料，可使活细胞中的线粒体呈现蓝绿色，而细胞质接近于无色。线粒体能在健那绿染液中维持活性数小时，通过染色可以在高倍显微镜下观察到生活状态的线粒体的形态和分布。
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