下列关于生物变异的说法，正确的是

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可遗传的变异包括基因突变、基因重组和染色体变异：
（1）基因突变是指基因中碱基对的增添、缺失或替换，这会导致基因结构的改变，进而产生新基因；
（2）基因重组是指在生物体进行有性生殖的过程中，控制不同性状的非等位基因重新组合，包括两种类型：①自由组合型：减数第一次分裂后期，随着非同源染色体自由组合，非同源染色体上的非等位基因也自由组合。②交叉互换型：减数第一次分裂前期（四分体），基因随着同源染色体的非等位基因的交叉互换而发生重组。此外，某些细菌（如肺炎双球菌转化实验）和在人为作用（基因工程）下也能产生基因重组。
（3）染色体变异包括染色体结构变异（重复、缺失、易位、倒位）和染色体数目变异。基因重组不会改变基因的结构，因此不会产生新基因，但其可能会改变DNA的碱基排列顺序，如交叉互换可使DNA上的碱基排列顺序改变，但基因结构不变，A正确；染色体上部分基因的缺失引起生物性状的改变属于染色体结构变异中的缺失，B错误；由基因突变引发的人类遗传病一般不能直接通过显微镜检测，但镰刀型细胞贫血症可通过显微镜检测红细胞的形态，C错误；基因结构包括编码区和非编码区，编码区又包括外显子和内含子，若发生缺失的碱基在内含子部分，则不影响编码的肽链长度，D错误。故选A。

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