A、有很多细菌生活在有氧的环境中,故A说法错误;
B、芽孢是细菌渡过不良环境的休眠体,不是生殖细胞,故B说法错误;
C、蘑菇也是依靠孢子繁殖后代,不会产生种子,故C说法错误;
D、绝大多数细菌和全部真菌体内不含叶绿素,自己不能制造有机物说法正确.
故选:D
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