共同进化指不同物种之间,生物与无机环境之间在相互影响中不断进化与发展。A、生物多样性是生物与生物之间、生物与环境之间协同进化的结果,A正确;B、突变和基因重组、自然选择和隔离是物种形成的三个基本环节,是生物进化的机制,B正确;C、生物进化的实质是种群基因频率的改变,自然选择可以决定生物进化的方向,C正确;D、生物多样性主要包括遗传多样性、物种多样性和生态系统多样性,D错误。故选D。
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