器官是由不同的组织按照一定的次序结合在一起形成具有一定功能的结构．绿色开花植物是由根、茎、叶、花、果实、种子六大器官组成的．根、茎、叶为营养器官，花、果实、种子为生殖器官．核桃仁属于种子，苹果属于果实，莲花属于花，甘薯属于根．因此，选项A、B、C 属于生殖器官，选项D属于营养器官．
故选：D．
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