细胞是除病毒以外生物体结构和功能的最小单位．组织是细胞分化的结果，细胞分化产生了不同的细胞群，每个细胞群都是由形态相似，结构、功能相同的细胞联合在一起形成的，这样的细胞群叫组织．器官是由不同的组织按照一定的次序结合在一起构成的．一株完整的绿色开花植物体由根、茎、叶、花、果实和种子六大器官构成．
A、洋葱表皮是由一群形态相似，结构、功能相同的洋葱表皮细胞联合在一起形成的，有保护作用，属于保护组织．故A错．
B、番茄果肉细胞就是一个个的细胞．故B错．
C、一颗小草是由根、茎、叶、花、果实和种子六大器官构成的一个植物体．故C错．
D、一粒菜豆种子 属于植物的六大器官之一．故D正确．
故选D
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