生物的多样性包括生物种类的多样性、基因的多样性、生态系统的多样性．保护生物多样性首先要保护生物的栖息环境、保护生态系统的多样性，生物的栖息环境是生物赖以生存的基础，保护了生物的栖息环境，即保护了环境中的生物，环境与生物是一个统一的整体，二者构成生态系统，因此保护生物的栖息环境，就是保护生态系统的多样性．保护生物的栖息环境、保护生态系统的多样性是保护生物多样性的根本措施．最有效的措施是建立自然保护区．可见D符合题意．
故选：D
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