A、孟德尔发现了遗传因子并证实了其传递规律,但没有证实其化学本质,A错误;
B、萨顿运用类比推理法提出基因在染色体上的假说,摩尔根运用假说演绎法证明基因在染色体上,B错误;
C、色盲是伴X隐性遗传病,女性患色盲,则母亲至少携带,母亲的色盲基因来自于外祖父或外祖母,所以外祖母不一定携带色盲基因,C正确;
D、基因不仅存在于细胞核中,也存在于叶绿体、线粒体等细胞器中,说明了基因不都在染色体上,不能证明基因与染色体行为存在着明显的平行关系,D错误.
故选:C.
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