A、生命系统中最基本的结构层次是细胞,不包括原子、分子,A错误;
B、病毒不属于生命系统的任何层次,病毒无呼吸作用,B错误;
C、群落是某一区域所有种群的总和,群落演替是生物与环境相互作用的结果,C正确;
D、生物圈的能量流动是单向的,但信息传递是双向的,D错误.
故选:C.
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