1. 先做序列分析。看是编码序列还是非编码序列。如果是编码序列,则看所编码的蛋白质功能。非编码序列,到Google上搜promoter prediction。然后输入你的序列。可以推测该序列作为promoter的功能。
2. 证明就是要做实验了。ChIP是金标准。原理就是先固定活细胞,使DNA和其上所结合的蛋白发生交联。再用超声震荡是DNA-蛋白质复合体的大小到1K左右。然后用针对该蛋白的抗体做免疫沉淀。这样只有和该蛋白结合的DNA才会被一起沉淀下来。然后复性DNA。收集后做PCR。看是不是你要的那段序列。
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