①颤藻为原核生物，酵母菌、水绵为真核生物，它们细胞内都含有DNA、RNA，且都能合成有机物，①正确；
②进行有氧呼吸的生物，体内具有不含线粒体的细胞，如哺乳动物的成熟红细胞，则该生物可能是真核生物，②错误；
③人的个体发育过程中，细胞分化的高峰期在胚胎时期，③错误；
④细胞分化的实质是基因的选择性表达，使各种细胞的mRNA不同，导致细胞的形态和功能各不相同，④正确；
⑤麻风杆菌为原核细胞，黑藻、酵母菌为真核生物，都具有细胞结构，且都有细胞壁，⑤正确．
故选：A．
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