A、肽键的数目不同可以使蛋白质的空间结构不同,A正确;
B、氨基酸的种类和排列顺序不同可以使蛋白质的空间结构不同,B正确;
C、核糖体是蛋白质的合成场所,与蛋白质的结构无关,C错误;
D、蛋白质的空间结构不同使蛋白质的种类不同,从而产生蛋白质的多样性,D正确.
故选:C
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