A、线粒体和叶绿体携带的基质中都含有少量的DNA和RNA,A、正确;
B、线粒体和叶绿体为双层膜结构,叶绿体内膜中是与光合作用有关的酶,线粒体膜中是与呼吸作用有关的酶,B正确;
C、线粒体内膜向内折叠形成嵴,线粒体内膜表面积大于外膜表面积,叶绿体刚好相反,C正确;
D、并不是所有的植物细胞都有叶绿体,植物体绿色部位才有叶绿体,D错误.
故选:D
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