解:A、构成物质的微粒有分子、原子、离子.故A错误; B、分子是保持物质化学性质的最小微粒.故B错误;C、由分子构成的物质发生化学变化时,分子本身发生了有改变,变成了其他物质的分子.故C错误;D、由同种分子构成的物质一定是纯净物,故D正确.故选D.【考点精析】通过灵活运用纯净物和混合物的判别和分子的定义与分子的特性,掌握纯净物是由同一种物质组成的物质.它包括单质和化合物.混合物是由多种物质组成的物质.混合物也可以由单质组成,如氢气和氧气在一起,就是由单质组成的混合物.总之混合物里至少有两种或两种以上的物质;分子是保持物质化学性质最小的微粒;性质:体积小、质量小;不断运动;有间隙即可以解答此题.
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