根据普通小麦为六倍体，42条染色体可判断，体细胞中含有6个染色体组，42条染色体．在减数分裂过程中，染色体数目减半，所以花药中配子含有3个染色体组，21条染色体．因此，科学家用花药离体培养培育出小麦幼苗是单倍体，含三个染色体组，21条染色体．
故选：C．
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