生物的多样性包括生物种类的多样性、基因的多样性和生态系统的多样性三个层次。生物多样性通常有三个层次的含义,即生物种类的多样性、基因(遗传)的多样性和生态系统的多样性。基因(遗传)的多样性是指物种的种内个体或种群间的基因变化,不同物种(水稻和小麦)之间基因组成差别很大,同种生物如野生水稻和普通水稻之间基因也有差别,每个物种都是一个独特的基因库。苹果有红富士、红星、红玉、国光等,这体现了生物多样性中的基因的多样性。
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