生物多样性中基因多样性受到破坏的主要原因是

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A、动物多种疾病蔓延，进而加剧对生物多样性的破坏，但是不是主要原因，故不符合题意．
B、地球气温逐年升高造成大量物种濒临灭绝，是生物多样性面临威胁的原因之一．
C、自然条件的恶化，如火山爆发、地震发生等自然灾害等尽管对生物造成不同程度的威胁，但不是使生物多样性受到破坏的主要原因．故不符合题意．
D、人类活动缺乏环保意识，毁林开垦，水土流失、环境恶化等原因会造成森林面积锐减，会使生物的栖息地丧失．在濒临灭绝的脊椎动物中，有67%的物种遭受生境丧失、退化与破碎的威胁，所以栖息地的丧失是主要的．故符合题意．
故选：D

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