A、大肠杆菌没有核膜，没有复杂的细胞器，但含有核糖体，A错误；
B、大肠杆菌是原核生物，没有染色体，不能进行有性生殖，其可遗传的变异只能来自基因突变，B错误；
C、大肠杆菌有两种环状DNA分子，即拟核中的环状DNA分子和细胞质中的质粒，C正确；
D、大肠杆菌的遗传物质是DNA，由4种脱氧核苷酸组成，D错误．
故选：C．
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