A、基因突变的结果是产生等位基因,基因突变可以产生新基因,A正确;
B、基因分离不能产生新基因,是减数分裂过程中遵循的遗传规律,B错误;
C、基因重组不能产生新基因,只是在原有基因的基础上重新组合,可以产生新基因型,C错误;
D、染色体数目变异,会改变基因的数量,不能产生新基因,D错误.
故选:A.
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