下列各项应用不属于基因工程的是

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A、转基因抗虫棉的培育过程是利用基因工程技术将苏云金芽孢杆菌的Bt毒蛋白基因转入到普通棉株细胞内，并成功的实现了表达，所以属于基因工程在实际中的应用，A错误；
B、探针是用放射性同位素（或荧光分子）标记的含有目的基因单链DNA片段，所以属于基因工程在实际中的应用，B错误；
C、“工程菌”是指利用基因工程技术将外源基因导入受体细胞的过程，所以属于基因工程在实际中的应用，C错误；
D、将C4植物细胞内的叶绿体移入C3植物细胞内属于细胞工程，不属于基因工程在实际中的应用，D正确．
故选：D．

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