在自然界中微生物之间关系复杂多样，归纳起来基本分为互生、共生、拮抗和寄生四种。其中，两种不同的生物，可以单独生存，但当其生活在一起时，可以由一方为另一方提供有利的生活条件，这种关系称为互生关系。互生关系可以是单方有利，也可以是双方互利。例如,水体中的氨化菌、氨氧化菌 (亚硝化细菌)和亚硝酸菌氧化菌(硝化细菌)之间存在着单方面有利的互生关系，虽然氨对硝化细菌有抑制作用， 但由于亚硝化细菌可把氨氧化成亚硝酸，不仅为硝化细菌解了毒，还提供了养料。
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