采样瓶一般可用玻璃瓶或者聚乙烯塑料瓶，瓶口必须能用盖或塞紧紧密封。当测定水样中油类或其他有机物时，使用玻璃瓶为宜，这是因为塑料会吸附有机物；当测定水中微量金属离子时，用塑料瓶为宜，这是因为玻璃会吸附金属离子;若测定二氧化硅时，应用塑料瓶而不能用玻璃瓶，因为玻璃瓶含有二氧化硅成分；水样为碱性水样时，不能使用玻璃瓶。
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