抗疱疹病毒药常见一过性血肌酐、尿素氮升高、血尿、蛋白尿、骨疏造血功能抑制、血小板计数减少、白细胞计数减少；偶见肾功能损害、肾衰竭。生殖系统少见睾丸萎缩、暂时或永久性的抑制精子产生；偶见经期紊乱；也可使妇女产生永久性不孕。更昔洛韦常可导致骨髓功能抑制，用药后约有40%的患者中性粒细胞计数减低至1.0*
/L以下，约20%的患者血小板计数减低至50*
以下，此外可有贫血。并可出现中枢神经系统症状，如精神异常、紧张、震颤等。偶有昏迷、抽搐等。有巨细胞病毒感染性视网膜炎的艾滋病患者可出现视网膜剥离。
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