在自然界中微生物之间关系复杂多样，归纳起来基本分为互生、共生、拮抗和寄生四种。其中，两种不同的生物，可以单独生存，但当其生活在一起时，可以由一方为另一方提供有利的生活条件，这种关系称为互生关系。互生关系可以是单方有利，也可以是双方互利。例如，水体中的氨化菌、氨氧化菌和亚硝酸菌氧化菌之间存在着单方面有利的互生关系。水中溶解的有机物会抑制氨氧化菌的发育，甚至可能导致其死亡。氨化菌能溶解有机氮化物，分解成氨或铰盐，这样既为氨氧化菌解了毒，又提供了氮素养料。氨对亚硝酸菌氧化菌有抑制作用，可因氨氧化菌把氨氧化成亚硝酸，就为它解了毒，还提供了养料。
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