根据《抗菌药物临床应用管理办法》，基层医疗卫生机构抗菌药物供应目录应（）
A、在省级药品监督管理部门备案
B、根据临床需要，随时增加总品种数
C、由医疗机构药学部门制定
D、选用基本药物目录中的抗菌药物品种
B、根据临床需要，随时增加总品种数
C、由医疗机构药学部门制定
D、选用基本药物目录中的抗菌药物品种
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考查抗菌药物供应目录。
其一，抗菌药物分级管理目录由省级卫生行政部门制定，本机构抗菌药物供应目录由医疗机构制定，向核发其《医疗机构执业许可证》的卫生行政部门备案。可见，选项A所涉及的政府部门错误，选项C将制定机构缩小为医疗机构一个部门。
其二，医疗机构应当严格控制本机构抗菌药物供应目录的品种数量，可以启动临床采购程序，但是调整后的抗菌药物供应目录总品种数不得增加，可见选项B说法错误。
其三，基层医疗卫生机构根据新阶段医药卫生体制改革精神，只能配备基本药物，抗菌药物也只能从基本药物中选择，选项D说法正确。故答案为D。
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