两株高果(G)南瓜杂交后, 后代高果(G)和矮果(g)的比例是3:1, 则亲本的基因组合方式应是:

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两株高果（G）南瓜杂交后在子代中出现了亲代中没有的性状---矮果，说明矮果是隐性性状，控制该性状的基因组成是gg，而这一对基因由亲本高果（G）南瓜个提供一个，因此亲代高果南瓜的基因组成是Gg，如图：

故选C。

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