区别在于：
组成部门负责人的任免，需要全国人大及其常委会通过；组成部门的负责人属于国务院全体会议成员，此会议是国务院最重要的会议，讨论决定国务院工作中的重大事项，及部署国务院的重要工作。组成部门可以直接以本部门的名义下达命令，职权比较大。
而其他机构，相当于国务院的办事机构，其负责人的任免不需要经过全国人大，是由国务院直接任免；只可以列席国务院全体会议，而且是要此次会议的主题跟其机构的职责相关的情况下。相对组成部门来说，职权比较小。比如新闻出版总署肯定比文化部职权小
国家海洋局是国土资源部管理的监督管理海域使用和海洋环境保护、依法维护海洋权益、组织海洋科技研究的行政机构。而国土部是国务院才是组成机构
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