河流筑坝的阻隔效应对水生生态有重大影响，这些影响包括大坝对洄游性鱼类的阻隔、流态改变对适流水或急流鱼类的影响。对“三场”（产卵场、越冬场、索饵场）的破坏、氮饱和对下游生物的影响等。评价中可能只针对一种影响作评价，那就要选择对这种影响有一定记载的河流和工程作为类比对象。
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