A、CO2和CO两种物质中，碳原子中的质子数都是6，质子数相同，故选项正确；B、一氧化碳中碳元素的质量分数=1228×100%≈42.9%，二氧化碳中碳元素的质量分数=1244×100%≈27.3%，故选项错误；C、碳元素的化合价，一氧化碳中碳元素是+2价，二氧化碳中碳元素是+4价，故选项错误；D、分子不同，性质不同，因此它们的化学性质不同，故选项错误；故选A
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